Rytų Europos studijų centro misija - vykdyti kokybišką politinių, ekonominių, socialinių procesų Rytų Europoje stebėjimą, analizę ir tyrimus, siekiant prisidėti prie pilietinės visuomenės ir demokratijos plėtros, teikti konsultacijas ir rekomendacijas vykdant bendradarbiavimo su Baltarusija, Ukraina, Moldova ir Gruzija projektus, atlikti ES Rytų kaimynystės politikos eksperto vaidmenį Lietuvoje ir Europoje.
Rytų Europos Studijų centras buvo įkurtas pagal 2006 m. Vilniaus universiteto vykdytą Phare Bendradarbiavimo abipus sienos programą Baltijos jūros regione. Idėja kurti šį centrą gimė Vilniuje. Lietuvai siekiant vykdyti aktyvią užsienio politiką Rytų Europoje, būtina turėti stiprų analitinį centrą, atliekantį profesionalią šiame regione vykstančių politinių, ekonominių ir socialinių procesų analizę.
2007 m. Rytų Europos studijų centras, plėsdamas savo veiklą, įsteigė "Demokratijos ir vystymo paramos fondą." Pagrindiniai fondo tikslai - skatinti laisvę ir demokratiją Rytų Europoje, spartinti bendradarbiavimą abipus sienos, kurti bendradarbiavimo tinklus ir skleisti informaciją apie demokratijos kūrimo procesą Rytų Europoje. Pagrindinė idėja - suteikti finansines galimybes greitai reaguoti į Rytų Europos nevyriausybinių organizacijų ir demokratijos lyderių poreikius.